原作 都築真紀
監督 草川啓造
脚本 都築真紀
放送期間 2007年4月1日 - 9月23日
話数 全26話
「闇の書事件」（魔法少女リリカルなのはA's）から10年後の新暦0075年。19歳になった高町なのは、フェイト・T・ハラオウン、八神はやての3人は、育まれた絆を胸に、それぞれの夢を追うべく時空管理局に所属。一流の魔導師として活躍していた。
そんな中で新たに発見されたロストロギア「レリック」とそれを狙う謎の機械兵器「ガジェットドローン」の出現。「レリック事件」と呼ばれるそれらの状況に対応するため、八神はやては迅速に対応できる部隊が必要だと思い、ロストロギア関連の任務を扱うための部隊「機動六課」を立ち上げる。
一方、遡ること4年前。スバル・ナカジマは空港火災に巻き込まれた際、なのはによって命を救われる。自身の理想を体現したかのような彼女に憧れたスバルは、満天の星空の下、管理局の魔導師になることを決意する。
それから4年経ち、紆余曲折の末に晴れて管理局魔導師として2年の実績を積んだスバルは、訓練校時代からのコンビパートナー、ティアナ・ランスターと共に魔導師の昇格試験に挑んでいた。それを見つめるのは「機動六課」の有望な人材として二人に目をつけたはやてとフェイト、そしてなのは。三人が見つめる中、試験開始を告げるリインフォースII（ツヴァイ）とともに『StrikerS』の物語が幕をあける。
オープニング（第1期）（1 - 17話）「SECRET AMBITION」
2007年4月18日発売
作詞：水樹奈々 作曲：志倉千代丸 編曲：藤間仁 (Elements Garden) 歌：水樹奈々
オープニング（第2期）（18 - 26話）「MASSIVE WONDERS」
2007年8月22日発売
作詞：水樹奈々 作曲・編曲：矢吹俊郎 歌：水樹奈々
エンディング（第1期）（1 - 14話）「星空のSpica」
2007年5月9日発売
作詞：椎名可憐 作曲・編曲：太田雅友 歌：田村ゆかり
エンディング（第2期）（15 - 26話）「Beautiful Amulet」
2007年8月1日発売
作詞：椎名可憐 作曲・編曲：太田雅友 歌：田村ゆかり
